O projeto teve início mediante a ação da European Medical Students' Association (EMSA), uma organização constituída por diversas associações de estudantes de Medicina a nível europeu, contando anteriormente com a participação de países como Suécia, Alemanha, Áustria, Croácia e Reino Unido.
O principal objetivo do “Hospital dos Pequeninos” é reduzir a ansiedade sentida pelas crianças dos 3 aos 7 anos de idade em situações médicas e no contato com profissionais de saúde. Estima-se que mais de duas mil crianças participarão nas sessões dedicadas às escolas, e várias outras centenas no Pavilhão do Conhecimento, sendo apenas necessário trazerem um brinquedo com um “dói-dói”.